Als reinigingsmiddel gebruik ik Chemipro Caustic als de flessen sterk vervuild zijn. Hierna zeer goed spoelen en net voor bottelen spoelen met een desinfecterend middel. Helaas schuimt dit middel behoorlijk, dus eigenlijk niet geschikt voor mijn spoelmachine.
Als de flessen niet erg vuil zijn kan je gebruik maken van Chemipro Oxi. Dit middel is een combinatie van een reinigings- en desinfecterend middel. Je hoeft het middel niet na te spoelen maar toch doe ik het kort met schoon leidingwater. Het nadeel van dit middel is dat het een witte waas achterlaat op de flessen.
Commerciële brouwerijen gebruiken een sterker middel, perazijnzuur. Dit middel, op basis van azijnzuur en waterstofperoxide, is zeer degelijk voor desinfectie, maar het middel is slecht te verkrijgen voor particulieren en niet zonder reden. Het is een gevaarlijk middel als het zonder enige kennis gebruikt wordt.